Ontwikkeling en toepassing van kwantitatieve PCR methoden voor het identificeren van de bron van fecale besmettingen

Aanleiding: opsporing bron van fecale verontreiniging – Fecale verontreiniging van drink- en oppervlaktewater (recreatie) vormt een risico voor de volksgezondheid. Bij aanwezigheid van fecaal materiaal in water is het mogelijk dat verschillende ziekteverwekkende micro-organismen van fecale herkomst in het water aanwezig zijn en daarmee een risico vormen. Met de methoden die routinematig gebruikt worden om (drink)watermonsters te screenen op de aanwezigheid van fecaal materiaal worden de fecale bacteriën E. coli en enterococcen via kweekmethoden aangetoond. Deze bacteriën zijn algemeen aanwezig in de feces van warmbloedige dieren. Daarmee zijn deze parameters waardevol om te bepalen of er fecale verontreiniging aanwezig is, maar er wordt dus geen informatie verkregen over de herkomst (welke diersoort?) van het aangetoonde fecaal materiaal. Kennis over de herkomst van een fecale besmetting is zeer waardevol. Deze kennis kan, in gevallen van fecale besmettingen, helpen om de bron (veroorzaker) op te sporen, om zeer gericht maatregelen te nemen om deze besmettingen te bestrijden en voorkomen. Kennis over de herkomst van fecale besmettingen maakt het ook mogelijk om het risico van een fecale besmetting beter in te schatten (bv. meer risico op virussen bij fecale verontreinigingen van mensen).
Doel: ontwikkelen methoden voor bronopsporing – Doelstelling van dit onderzoek was de ontwikkeling van methoden waarmee fecale bacteriën van specifieke diergroepen kunnen worden aangetoond.