Full-length 16S rRNA gene sequencing for improved taxonomic identification of bacterial communities

Full-length 16S rRNA gen-sequencing blijkt in potentie bruikbaar als “brede microbiologische screening” voor (drink)water. De onderzochte methode, LoopSeq van de firma Loop Genomics is nog niet geschikt om ook bacteriën met lage aantallen (waaronder pathogenen) in het drinkwatermilieu te identificeren. Vervolgonderzoek zal zich richten op toepassingsmogelijkheden van alternatieve full-length 16S rRNA gen-methoden (zoals het recent sterk verbeterde MinION systeem) waarmee mogelijk beter bacteriën kunnen worden geïdentificeerd die in lage aantallen aanwezig zijn.